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  • 全球通訊!科學(xué)家用新的無(wú)細(xì)胞蛋白質(zhì)結(jié)晶方法推進(jìn)結(jié)構(gòu)生物學(xué)的發(fā)展

    時(shí)間:2022-10-03 20:23:42 來(lái)源: cnBeta.COM



    【資料圖】

    CFPC過(guò)程的示意圖,使用小麥胚芽蛋白合成試劑盒合成多面體單體(PhM),并進(jìn)一步結(jié)晶為納米級(jí)多面體晶體。資料來(lái)源:Takafumi Ueno教授

    我們大多數(shù)人都熟悉某些晶體,如鹽和糖,我們?cè)谌粘I钪惺褂眠@些晶體。然而,還有一組隱藏在肉眼之外的晶體,對(duì)我們的生物學(xué)至關(guān)重要。在活細(xì)胞中,微觀的蛋白質(zhì)晶體幫助維持免疫系統(tǒng)激活、蛋白質(zhì)儲(chǔ)存和保護(hù)等過(guò)程。

    科學(xué)家們開發(fā)了細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)結(jié)晶(ICPC)方法,以更好地了解蛋白質(zhì)晶體的結(jié)構(gòu)和功能之間的關(guān)系。這種方法可以直接觀察活細(xì)胞中的蛋白質(zhì)晶體,確保高質(zhì)量的晶體,而不需要純化過(guò)程或復(fù)雜的篩選方法。然而,盡管它有許多優(yōu)勢(shì),但由于在活細(xì)胞中形成的晶體沒(méi)有分析所需的大小和質(zhì)量,所以報(bào)告的結(jié)構(gòu)很少。因此,由東京理工大學(xué)的Takafumi Ueno教授領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)日本科學(xué)家團(tuán)隊(duì)旨在開發(fā)一種更好的方法。而最近,他們?nèi)〉昧送黄菩赃M(jìn)展。

    多面體晶體(PhCs)的掃描電子顯微鏡圖像和尺寸分布直方圖顯示了隨時(shí)間變化的CFPC過(guò)程中的不同點(diǎn)。資料來(lái)源:Takafumi Ueno教授

    在他們將于今天(10月3日)發(fā)表在《科學(xué)報(bào)告》上的文章中,該團(tuán)隊(duì)報(bào)告了一項(xiàng)技術(shù)的發(fā)展,該技術(shù)將使蛋白質(zhì)結(jié)晶和分析更加高效和有效。這種技術(shù)--無(wú)細(xì)胞蛋白質(zhì)結(jié)晶(CFPC)方法--是體外蛋白質(zhì)結(jié)晶和ICPC的混合體,可以快速直接形成蛋白質(zhì)晶體,而不需要復(fù)雜的結(jié)晶和純化方法。

    "ICPC有望成為晶體結(jié)構(gòu)分析的一個(gè)重要工具,但我們需要一種方法來(lái)獲得分辨率更高的蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu)。因此,我們專注于利用CFPC建立高質(zhì)量的蛋白質(zhì)結(jié)晶,并進(jìn)行小規(guī)模的快速反應(yīng),"上野教授說(shuō),他也是東京理工大學(xué)上野實(shí)驗(yàn)室的負(fù)責(zé)人。該實(shí)驗(yàn)室的成員研究自然發(fā)生的蛋白質(zhì)組合,它們的結(jié)構(gòu)和功能,旨在應(yīng)用這些知識(shí)來(lái)開發(fā)創(chuàng)新的生物技術(shù)和能源解決方案。(進(jìn)行當(dāng)前研究的研究小組中的一些科學(xué)家也是上野實(shí)驗(yàn)室的成員)。

    研究小組使用了一個(gè)小麥胚芽蛋白合成試劑盒,這是一種用于合成多面體單體的工具,多面體單體是一種在昆蟲細(xì)胞中通過(guò)Hypovirus感染產(chǎn)生的病毒蛋白。然后使用新的CFPC方法對(duì)這種蛋白質(zhì)進(jìn)行結(jié)晶,從而形成納米級(jí)的多面體晶體(PhCs)??茖W(xué)家們可以在6小時(shí)內(nèi)有效地完成這一過(guò)程,期間只用了20微升的反應(yīng)混合物。掃描電子顯微鏡圖像表明,PhCs具有極佳的純度,這使得他們能夠以高達(dá)1.95?(或1.95?)的分辨率確定其結(jié)構(gòu)。為了進(jìn)一步探索他們新系統(tǒng)的能力,研究人員對(duì)結(jié)晶包涵蛋白A(CipA)進(jìn)行了結(jié)構(gòu)分析,其結(jié)構(gòu)被確定為2.11?的高分辨率,這在這項(xiàng)研究之前從未被報(bào)道過(guò)。

    這項(xiàng)工作是結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域的一次重大飛躍,因?yàn)樗岢龅姆椒▽⑹谷藗兡軌蚍治鰺o(wú)法通過(guò)傳統(tǒng)方法研究的不穩(wěn)定和低產(chǎn)量的蛋白質(zhì)。這項(xiàng)技術(shù)還旨在幫助開發(fā)小規(guī)模和快速蛋白質(zhì)結(jié)晶和分析的先進(jìn)技術(shù)。"上野教授總結(jié)說(shuō):"由我們的方法產(chǎn)生的高質(zhì)量蛋白質(zhì)晶體將擴(kuò)大結(jié)構(gòu)測(cè)定的范圍,并為我們提供對(duì)活細(xì)胞復(fù)雜環(huán)境的有用和前所未有的洞察力。"


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