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  • 焦點速遞!駁斥60年前的假說:研究發(fā)現(xiàn)大多數(shù)“沉默”突變實際上是有害的

    時間:2022-08-23 08:37:20 來源: cnBeta.COM


    他們發(fā)現(xiàn)了三個字母的DNA單元,稱為(遺傳)密碼子 ,描述了組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸中的每一種。這一發(fā)現(xiàn)為尼倫伯格和其他兩人贏得了諾貝爾獎。

    偶爾也會發(fā)生遺傳密碼中的單字母錯位,即所謂的點突變。非同義突變是改變由此產(chǎn)生的蛋白質(zhì)序列的點突變,而沉默或同義突變則不改變蛋白質(zhì)的序列。

    四分之一到三分之一的蛋白質(zhì)編碼DNA序列點突變是同義的。自遺傳密碼被破譯以來,它們通常被認為是中性或幾乎中性的突變。


    (資料圖片僅供參考)

    但是在最近發(fā)表在《自然》雜志上的一項研究中,密歇根大學的生物學家們在實驗室中對酵母細胞進行了遺傳操作,表明大多數(shù)同義突變是非常有害的。

    研究作者說,如果發(fā)現(xiàn)其他基因和其他生物體中的大多數(shù)同義突變具有強烈的非中立性,將對人類疾病機制、群體和保護生物學以及進化生物學的研究產(chǎn)生重大影響。

    “自從20世紀60年代解決了遺傳密碼以來,人們普遍認為同義突變是良性的。我們現(xiàn)在表明,這種想法是錯誤的,”該研究的高級作者、密歇根大學生態(tài)學和進化生物學系教授Jianzhi"George"Zhang說。

    “因為許多生物學結(jié)論都依賴于同義突變是中性的這一假設,其無效性具有廣泛的影響。例如,在對致病突變的研究中,同義突變通常被忽視,但它們可能是一種未被重視的常見機制。”

    在過去十年中,有傳聞表明,一些同義突變是非中性的。George和他的同事想知道這種情況是例外還是常規(guī)。

    他們選擇在出芽酵母(Saccharomyces cerevisiae)中解決這個問題,因為這種生物體的生成時間短(約80分鐘),體積小,使他們能夠相對快速、精確和方便地測量大量同義突變的影響。

    他們使用CRISPR/Cas9基因組編輯技術構建了8000多個突變的酵母菌株,每個菌株都在研究人員鎖定的21個基因中攜帶了同義、非同義或無義突變。

    然后他們通過測量每個突變株相對于非突變株的繁殖速度來量化其“適合度”。簡單地說,達爾文適合度是指個體擁有的后代數(shù)量。在這種情況下,測量酵母菌株的繁殖率表明突變是有益的、有害的還是中性的。令他們驚訝的是,研究人員發(fā)現(xiàn)75.9%的同義突變是明顯有害的,而1.3%是明顯有益的。

    研究的主要作者沈旭康(音譯,George實驗室的一名研究生研究助理)說:“以前關于非中性同義突變的軼事被證明是冰山一角。”

    “我們還研究了同義突變影響適合度的機制,發(fā)現(xiàn)至少有一個原因是同義和非同義突變都會改變基因的表達水平,而這種表達影響的程度可以預測適合度效果。”

    George說,研究人員事先就知道,根據(jù)傳聞報告,一些同義突變很可能會變成非中性的。他說:“但是我們被大量的這種突變震驚了。我們的結(jié)果暗示,同義突變在導致疾病方面幾乎與非同義突變一樣重要,并呼吁加強預測和識別致病性同義突變的努力?!?/p>

    馬薩諸塞州大學領導的團隊說,雖然沒有特別的理由說明他們的結(jié)果會局限于酵母,但需要在不同的生物體中進行確認,以驗證其發(fā)現(xiàn)的普遍性。


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