在過去的幾年里,藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域已經(jīng)取得了很大的進(jìn)步,首先是快速和廉價的基因轉(zhuǎn)錄,然后是CRISPR及人工智能驅(qū)動的蛋白質(zhì)組學(xué)等。最終,無論它們?nèi)绾渭铀倩A(chǔ)研究,體內(nèi)測試仍然是一個主要瓶頸。
體內(nèi)(in vivo)是指 “在生物體內(nèi)進(jìn)行的”,而不是體外(玻璃中)或硅(模擬)。小鼠是通常的小動物,獲得了測試新藥安全性和有效性的可疑榮譽(yù)。一般的公式是:一種藥物,一只小鼠。由于這是藥物測試中具有挑戰(zhàn)性和耗時的部分,通常要等到公司或?qū)嶒炇抑挥猩贁?shù)幾個分子有相當(dāng)大的把握時才會進(jìn)行。但這也是任何這些藥物第一次--往往也是最后一次--在真實的體內(nèi)中實際發(fā)揮作用,結(jié)果是許多藥物的研究被終止。
初創(chuàng)公司Manifold Bio最近獲得了4000萬美元的A輪融資,旨在使小鼠試驗的效率和效果提高100倍,改變這一等式,在投入價值幾百萬美元的資源之前,實現(xiàn)更早的體內(nèi)測試,驗證分子的功能。
【資料圖】
“最佳的測試環(huán)境是現(xiàn)實,”Manifold Bio公司的創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官Gleb Kuznetsov解釋說?!暗?dāng)你在藥物開發(fā)項目中走得更遠(yuǎn)時,你的投資越來越多,要做越來越多昂貴的實驗和工作。我們更早地進(jìn)行優(yōu)化,所以一旦我們到了進(jìn)入臨床試驗的最后關(guān)頭,我們就會帶著已經(jīng)優(yōu)化過的藥物前進(jìn)。如果你能更加確信這是一個正確的投資藥物,你就能解決投資的關(guān)鍵風(fēng)險。”
目前,在小鼠測試階段,研究人員通常有一個目標(biāo)條件和少數(shù)幾個候選藥物分子。每只小鼠體內(nèi)都有一個,他們觀察會發(fā)生什么--在這個關(guān)鍵階段,確實有可能所有的小鼠都會失敗。
Manifold的創(chuàng)新是將體內(nèi)測試平行化,在一只小鼠身上同時進(jìn)行多達(dá)100次測試。為了實現(xiàn)這一目標(biāo),它發(fā)明了一種“蛋白質(zhì)條碼”技術(shù),你可以把它看作是分子RFID標(biāo)簽。
Kuznetsov說:“它的工作方式是我們附加一個額外的蛋白質(zhì)位,即我們的蛋白質(zhì)條形碼,這使得蛋白質(zhì)可以被追蹤,我們可以追蹤它在一個系統(tǒng)中的任何地方。與其說是驗證實驗室測試,不如說是為設(shè)計提供參考。有很多人工智能和機(jī)器學(xué)習(xí)驅(qū)動的開發(fā),有很多計算機(jī)上的設(shè)計。我們專注于一個特定的癌癥目標(biāo),即癌細(xì)胞表面的一些東西,這些東西真正標(biāo)志著這是一個癌細(xì)胞,并找出非常專門針對這些癌細(xì)胞的藥物設(shè)計--而不是其他地方。”
這里的問題是,在這個階段,你可能會看到一千種不同的蛋白質(zhì),其中每一種可能只與其他蛋白質(zhì)有幾個氨基酸的差異,這些氨基酸是賦予蛋白質(zhì)形狀和功能的構(gòu)件。
這就是Manifold的條形碼的用處。每種蛋白質(zhì),無論多么相似,都有一個標(biāo)簽,這個標(biāo)簽是完全獨特的,在通過專有的DNA轉(zhuǎn)換過程后可以識別。等量的100個分子進(jìn)入小鼠體內(nèi),可能95個沒有任何作用,3個可以很好地附著在癌細(xì)胞上,2個以更高的速率附著。這就是98個分子,而不必通過進(jìn)一步的測試。
這個篩選過程將很多不確定因素排除在外,因為研究人員肯定知道這個蛋白質(zhì)在一個活的哺乳動物系統(tǒng)中確實發(fā)揮了他們設(shè)計的作用。而這是在設(shè)計和小批量合成之后,相對便宜和流程的早期部分。
最困難的部分是設(shè)計標(biāo)簽本身。每個小的蛋白質(zhì)條形碼都必須滿足一個非常高的標(biāo)準(zhǔn)。
“有一個分子生物學(xué)的組成部分,但也有很多使這些東西可以檢測的計算方面的問題。它們還必須不影響藥物的行為,而且必須是穩(wěn)定的、可檢測的、獨特的和可制造的,” Kuznetsov說。設(shè)計一個將是一個挑戰(zhàn)--設(shè)計100個可能是一個全新的藥物開發(fā)路徑的基礎(chǔ)。他把它比作從CPU的串行處理到GPU的并行處理時發(fā)生在計算領(lǐng)域的變化。
不過,要清楚的是,這并不是要為其他公司的測試增壓--Manifold的目標(biāo)是在這種注入生物技術(shù)的測試方法的基礎(chǔ)上建立整個垂直整合的藥物公司。
Kuznetsov表示:“我們在內(nèi)部進(jìn)行端到端的研究。我們內(nèi)部的藥物,我們從頭開始創(chuàng)造了這些分子,我們已經(jīng)把它們放在這些集合的體內(nèi)測試中,它們很快就會達(dá)到臨床試驗的水平?!?/p>
他們的種子輪融資是為了建立基礎(chǔ),并展示技術(shù)的有效性--現(xiàn)在已經(jīng)做到了。4000萬美元的A輪融資是為了開始更昂貴和標(biāo)準(zhǔn)化的臨床測試過程。該公司目前專注于癌癥,因為這不僅是一個巨大的威脅,而且與這個過程擅長尋找的藥物類型很匹配。
該公司由 Kuznetsov和他的聯(lián)合創(chuàng)始人經(jīng)營,但遺傳學(xué)先驅(qū)喬治·丘奇幫助提出并建立了該公司的開始。他目前是一名顧問。
新一輪融資由Triatomic Capital領(lǐng)投,新投資者Section 32、FPV Ventures、Horizons Ventures和騰訊,以及現(xiàn)有投資者Playground Global、Fifty Years和FAST by GETTYLAB參與。
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