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  • 科學(xué)家對(duì)深海沉積物中的真核生物DNA進(jìn)行大規(guī)模測(cè)序

    時(shí)間:2022-02-07 16:53:23 來(lái)源: cnBeta


    深海海底是地球上探索最少的生態(tài)系統(tǒng),盡管它覆蓋了地球表面的60%以上。深海沉積物中大量未知的生命,從底棲動(dòng)物到微生物,幫助回收或封存來(lái)自浮游生物群落的沉降(非)有機(jī)物,而浮游生物在數(shù)量上占主導(dǎo)地位。因此,底棲生態(tài)系統(tǒng)支撐著對(duì)地球具有重要意義的兩大生態(tài)系統(tǒng)服務(wù):海洋食物網(wǎng)的健康運(yùn)作和地質(zhì)時(shí)間尺度上的碳埋藏,這兩者都是地球氣候的關(guān)鍵調(diào)節(jié)器。

    來(lái)自挪威研究中心(NORCE)、Bjerknes氣候研究中心、日內(nèi)瓦大學(xué)以及法國(guó)的CNRS/Genoscope和IFREMER的研究人員對(duì)所有主要大洋盆地的深海沉積物中的真核生物DNA進(jìn)行了大規(guī)模測(cè)序,并將這些新數(shù)據(jù)與Tara Oceans和Malaspina環(huán)形全球考察隊(duì)獲得的現(xiàn)有全球規(guī)模浮游生物數(shù)據(jù)集進(jìn)行對(duì)比。這提供了從表層到深海沉積物的整個(gè)海洋真核生物多樣的第一個(gè)統(tǒng)一視野,使海洋生態(tài)問(wèn)題首次在全球范圍內(nèi)和在海洋的三維空間中得到解決,代表了向 “一個(gè)海洋生態(tài)學(xué)”邁出的重要一步。

    NORCE和挪威Bjerknes氣候研究中心的研究員、該研究的主要作者Tristan Cordier說(shuō):“有了全世界從表面到深海海底的1700個(gè)樣本和20億條DNA序列,高通量環(huán)境基因組學(xué)極大地?cái)U(kuò)展了我們研究和了解深海生物多樣、其與上面水體的聯(lián)系以及全球碳循環(huán)的能力。”

    什么東西生活在這個(gè)黑暗和惡劣的環(huán)境中?

    通過(guò)比較沉積物的DNA序列和來(lái)自遠(yuǎn)洋領(lǐng)域的DNA序列,有可能將本地的底棲生物與從上層水柱到達(dá)海底的沉浮物區(qū)分開(kāi)來(lái)。結(jié)果表明,這種底棲生物的多樣可能比上面的水體大三倍;而且這種多樣是由非常不同的分類群組成的,這些分類群大多是未知的。

    “我們將我們的深海底棲動(dòng)物DNA序列與所有已知真核生物的參考序列進(jìn)行了比較。我們的數(shù)據(jù)表明,三分之二的底棲生物多樣不能歸入任何已知的組別,揭示了我們?cè)诤Q笊锒鄻?span id="otrura3" class="keyword">性知識(shí)方面的一個(gè)重大空白,”日內(nèi)瓦大學(xué)遺傳學(xué)和進(jìn)化系以及位于索波特的波蘭科學(xué)院海洋學(xué)研究所的教授Jan Pawlowski說(shuō)。

    深海沉積物中的浮游生物DNA能告訴我們什么?

    對(duì)深海沉積物中浮游生物DNA的豐度和組成的分析證實(shí),極地地區(qū)是碳封存的熱點(diǎn)地區(qū)。此外,沉積物中浮游生物DNA的組成預(yù)測(cè)了生物泵的強(qiáng)度變化,這是一個(gè)將大氣中的二氧化碳轉(zhuǎn)移到深海的生態(tài)系統(tǒng)過(guò)程,從而調(diào)節(jié)了全球氣候。

    法國(guó)羅斯科夫國(guó)家科學(xué)研究中心的研究員Colomban de Vargas說(shuō):“我們第一次可以了解浮游生物群落的哪些成員對(duì)生物泵貢獻(xiàn)最大,這可以說(shuō)是海洋中最基本的生態(tài)系統(tǒng)過(guò)程。”

    深海將如何受到全球變化的影響?

    這個(gè)基因組數(shù)據(jù)集代表了現(xiàn)代海洋中整個(gè)真核生物多樣的第一個(gè)一致快照。它提供了一個(gè)獨(dú)特的機(jī)會(huì),從累積的沉積物記錄中包含的DNA來(lái)重建古代海洋,以評(píng)估氣候在過(guò)去如何影響浮游生物和底棲生物群落。

    “我們的數(shù)據(jù)不僅可以解決關(guān)于海洋真核生物的生物多樣、生物地理學(xué)和連接的全球規(guī)模問(wèn)題。它還可以作為一個(gè)基礎(chǔ),從古代沉積DNA檔案中重建生物泵過(guò)去的功能。然后,它將為其在更溫暖的海洋中的未來(lái)力量提供信息,這對(duì)于模擬氣候變化下的未來(lái)碳循環(huán)是很關(guān)鍵的,”Tristan Cordier解釋說(shuō)。

    “我們的研究進(jìn)一步表明,深海生物多樣的研究是極其重要的。大量未知的生物棲息在海底沉積物中,并且一定在生態(tài)和生物地球化學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著基本作用。如果我們要保護(hù)這些巨大的、相對(duì)原始的生態(tài)系統(tǒng)不受未來(lái)可能的人類入侵的影響,并了解氣候變化對(duì)它的影響,更好地了解這種豐富的多樣是至關(guān)重要的。”南安普頓國(guó)家海洋學(xué)中心的名譽(yù)研究員Andrew J. Gooday總結(jié)道,他也參與了這項(xiàng)研究。


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